Het vermogen van Stichting Willem van Genk bestaat uit de eigendom van werken van Willem van Genk. De Stichting beschikt over de ANBI-status. De grootste kostenpost is collectiebeheer en ontsluiting. Deze kosten worden gedragen door Museum van de Geest. Het bestuur verricht haar taken onbezoldigd. Er is dan ook sprake van een zeer bescheiden kasstroom.
De Stichting kende in 2021 nauwelijks uitgaven, enkel wat kleinere posten waaronder bankkosten en abonnementsgelden. In 2021 verkreeg de stichting geen inkomsten.